Zgodnie z rządowym projektem ustawy o zmianie ustawy o podatku od towarów i usług oraz niektórych innych ustaw nowelizacja objęła również ustawę o służbie cywilnej. Zmiana ma dotyczyć zapisów dotyczących rekompensowania pracy w godzinach nadliczbowych, co dotychczas regulował art. 97 ustawy z 21 listopada 2008 roku o służbie cywilnej. Zgodnie z projektowanymi przepisami pracownikowi służby cywilnej miałby przysługiwać czas wolny w tym samym wymiarze albo wynagrodzenie za pracę w godzinach nadliczbowych wykonywaną na polecenie przełożonego w porze nocnej, niedzielę i święto albo w dniu wolnym udzielonym w zamian za pracę w niedzielę i święto.
Natomiast w przypadku osób zajmujących wyższe stanowisko w służbie cywilnej (dyrektor generalny urzędu i kierownik urzędu) praca w godzinach nadliczbowych w dni powszednie nie byłaby rekompensowana, co pozwoliłoby zachować zgodność z ogólnymi przepisami prawa pracy, zgodnie z którymi osobom zarządzającym zakładem pracy w imieniu pracodawcy nie przysługuje rekompensata za godziny nadliczbowe.
W projekcie pojawił się również nowy art. 97a, w którym określony jest sposób wyliczania wynagrodzenia za pracę w godzinach nadliczbowych, oraz termin i forma składania wniosku o wypłatę̨ wynagrodzenia.
